在这部的故事里,海底探险小队将会穿越《巨齿鲨》系列电影第一部中被意外发现的深海温跃层,带领观众一同潜入已经与世隔绝几千万年的神秘史前海底世界。预告中,陆地巨蜥、恐龙、巨型大章鱼等远古怪兽挨个现身,还有体型更庞大、数量更多、攻击力更强的巨齿鲨群。这不仅意味着,影片中温跃层下的深海怪兽世界观有了雏形;同时,这也意味着相比上一部而言更多的刺激、危机、惊险和尖叫。本片基于基于凯文·弗林与加里·格哈特所著书籍《沉默兄弟会》改编,讲述关于这个白人至上主义恐怖组织不断升级的罪行。小说的故事设定在1983年,在当时,一系列银行抢劫、伪造假币和运钞车抢劫案让整个太平洋西北地区的社区陷入恐惧,执法人员争先恐后寻找答案,一名驻扎在爱达荷州宁静、风景如画的小镇科达伦的联邦调查局特工(裘德·洛 饰),开始相信这些罪行不是以金钱为动机的犯罪分子干的,而是一群危险的恐怖分子所为,他们受到一个激进的领导人(霍尔特)的鼓舞,策划了一场针对美国联邦政府的毁灭性战争。